flatpak 1.12.2
下記コマンドを実行してgeditのテーマをAdwaitaダークに変更する。
※ちなみに環境によっては「~/.themes/」か「~/.local/share/themes/」にテーマを入れておかないと動かない場合もある
$ flatpak override --env=GTK_THEME=Adwaita:dark org.gnome.gedit --user
元に戻すには下記コマンドを実行する。
$ flatpak override --reset org.gnome.gedit --user