下記のファイルを編集する。
# vi /usr/share/glib-2.0/schemas/org.gnome.desktop.interface.gschema.xml
scaling-factorのdefaultを変更したい値にする。
……
<key name="scaling-factor" type="u">
<default>2</default>
<summary>Window scaling factor</summary>
<description>
Integer factor used to scale windows by. For use on high-dpi screens.
0 means pick automatically based on monitor.
</description>
</key>
……
コンパイルする。
# glib-compile-schemas /usr/share/glib-2.0/schemas/